第一、设枢密司，下分：

军籍处，主导兵员和各地方团勇登记、征集、后备兵员的调发。

军功处：负责军功考核、登记、及官兵年资，核转，封赏。

勤务处：负责钱粮装备的征集、调发和供应。

训练司：主管新兵编练和老兵操训。

监军处：随军督战，掌军中教化宣传。

办公处：掌管本司文书进出分发和本司庶务

枢密司长官为枢密长史，枢密参军为辅

第二、设参军司，下分：

参谋处，主导各地山川图集，汇总敌我军情，拟定作战计划的确定。

军令处，主导军队调动和监督指导作战军团的执行。

军情处：负责军情侦缉和各地山川图形的绘制。

办公处：掌管本司文书进出和本司庶务

参军司长官为参军长史，参军司马为辅

第三、设庶政司，下分：

户曹：协理天下钱粮和图籍人口

工曹：主管各地工程、土木建设。

农曹：主管各地农桑水利。

刑曹：主管刑案复核侦破。

吏曹：主管官员调配、征辟、考核。

商曹：主管商务发展、管理和税务。

学曹：主管学校教育和科研发展。

办公处：掌管本司文书进出和本司庶务

庶政司长官为庶政长史，庶政司马为副，各曹长官为郎中。

第四、设元老院

元老院乃征召各地元老组建，负责审核决议庶政司各项庶务。并对庶务司各司曹长官进行监察，并提出弹劾。同设办公处。

第五、设昭文院

昭文院乃征召各地文学之士，内分：

内书房：为天策长官的随身书记，负责制令拟定，记录长官言行。

通政房：封驳副署内书房发出的制令，传递各地庶政章表。

文学院：掌管礼法教化，倡导文学

第六、设侍卫司 掌管长官府和长官本人的侍卫和长官庶务，

设侍卫司马、侍卫郎中为首，并管带、操训侍卫兵马。

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